棉花角斑病不仅危害棉苗，同时也危害成株的茎叶及发育中的棉铃，苗期染病，子叶受害呈水渍不规则或圆形病斑，黑褐色，严重的子叶枯死脱落，真叶染病，叶背先产生深绿色小点，后扩展成油渍状，叶片正面病斑多角形，有时病斑沿脉扩展呈不规则条状，致叶片枯黄脱落，茎染病，现水渍状病斑，后扩大变黑或腐烂，病部凹陷，病苗弯向一边，顶芽染病，形成“烂顶”，造成全株死亡，湿度大时，病部分泌出粘稠状黄色菌脓，干燥条件下变成薄膜或碎裂成粉末状，棉铃染病，初生油侵状深绿色小斑点，后扩展为近圆形或多个病斑融合不规则形，褐色至红褐色，病部凹陷，幼铃脱落，成铃部分心室腐烂。
1、提倡采用垄作或高畦，科学灌溉，严禁大水漫灌，串灌，及时中耕放墒。
2、种子处理，采取浓硫酸脱绒可消灭棉种短绒带菌，具体方法参见棉花黄萎病，也可沿用“三开一凉”温水浸种半小时。
3、加强田间管理，在台风，大雨过后，及时追肥，并喷洒1：1：120-200倍式波尔多液或25%叶枯唑可湿性粉剂500倍液或72%农用硫酸链霉素4000倍液。
4、采摘完毕后及时清除棉田病株残体，集中沤制或烧毁。
5、精选棉种，合理密植，雨后及时排水，防止湿气滞留，结合间苗，定苗发现病株及时拔除。
6、采用配方施肥持术，提倡施用酵素菌沤制的堆肥，避免偏施，过施氮肥。
