棉花棉根蚜在棉花主根附近吸取棉根汁液，致受害主根下部及须根变细或枯萎、变黑或腐烂。植株地上部叶色变暗、打蔫，棉苗生长缓慢，棉茎变红或嫩顶枯萎，叶片变薄或枯萎下垂。严重时成片棉苗被害枯死。
棉根蚜在土壤中呈水平分布，距植株周围5cm处最多，15cm处次之，垂直分布在5—10cm土层内。怕光，见光即向土缝中爬行，在土中常与小黄蚁共生，靠小黄蚁搬迁或转移为害。沙壤土、壤土土质松软、通透性好发生为害重，连作田易发生，气温高发生早，多雨的年份也有发生为害重的。据山东调查：4月下旬—5月上旬，日均温14.4—17.8℃，棉根蚜于5月13日始发，最晚的在5月25日。
防治方法 (1)轮作。(2)清除田间、地边杂草。(3)药剂拌种 用3%呋喃丹颗粒剂，每667m2用量1.5kg或l5%铁灭克颗粒剂0.25kg拌种，药后50天防效仍在90%以上。此外也可选用10%吡虫啉可湿性粉剂78或3%1605颗粒剂、3%久效磷颗粒剂，每667m2 1.5kg拌种，1个月有效。(4)药剂灌根 在棉根蚜发生初期灌浇50%辛硫磷乳油或20%灭多威乳油1500倍液、10%吡虫啉可湿性粉剂1500倍液、50%抗蚜威可湿性粉剂3000倍液、40%久效磷乳油2500倍液、40%甲基异柳磷乳油2000倍液、35%赛丹乳油1500倍液，l0天防效80—90%。
