水稻纹枯病苗期至穗期都可发病。叶鞘染病 在近水面处产生暗绿色水浸状边缘模糊小斑，后渐扩大呈椭圆形或云形，中部呈灰绿或灰褐色，湿度低时中部呈淡黄或灰白色，中部组织破坏呈半透明状，边缘暗褐。发病严重时数个病斑融合形成大病斑，呈不规则状云纹斑，常致叶片发黄枯死。叶片染病 病斑也呈云纹状，边缘褪黄，发病快时病斑呈污绿色，叶片很快腐烂，茎秆受害 症状似叶片，后期呈黄褐色，易折。穗颈部受害 初为污绿色，后变灰褐，常不能抽穗，抽穗的秕谷较多，千粒重下降。湿度大时，病部长出白色网状菌丝，后汇聚成白色菌丝团，形成菌核，菌核深褐色，易脱落。高温条件下病斑上产生一层白色粉霉层即病菌的担子和担抱子。
防治措施：(1)选用抗病品种，水稻对纹枯病的抗性是水稻和病原菌相互作用的一系列复杂的物理、化学反应的结果，水稻植株具蜡质层、硅化细胞是抵抗和延缓病原菌侵入的一种机械障碍，是衡量品种抗病性指标，也是鉴别品种抗病性的一种快速手段。水稻对纹枯病抗性高的资源较少，各地应因地制宜选用抗耐病品种。
(2)打涝菌核，减少菌源。要每季大面积打涝并带出田外深埋。
(3)加强栽培管理，施足基肥，追肥早施，不可偏施氮肥，增施磷钾肥，采用配方施肥技术，使水稻前期不披叶，中期不徒长，后期不贪青。灌水做到分蘖浅水、够苗露田、晒田促根、肥田重晒、瘦田轻晒、长穗湿润、不早断水、防止早衰，要掌握“前浅、中晒、后湿润”的原则。
(4)药剂防治。抓住防治适期，分蘖后期病穴率达15%即施药防治。首选广灭灵水剂500-1000倍液或5%井冈霉素 100ml对水 50L喷雾或对水 400L泼浇。或每 667㎡用 20%粉锈宁乳油 50-76ml、50%甲基硫菌灵或50%多菌灵可湿性粉剂100g、30%纹枯利可湿性粉剂50-75g、50%甲基立枯灵(利克菌)或33%纹霉净可湿性粉剂2009，每667㎡用药液50L。也可用20%稻脚青(甲基砷酸锌)或10%稻宁(甲基砷酸钙)可湿性粉剂100g加水100L喷施，或加水400-500L泼施，或拌细土25kg撒施。还可用5%田安(甲基砷酸铁胺)水剂200g加水100L喷雾或对水400L浇泼，或用500g拌细土20kg撒施，注意用药量和在孕穗前使用，防止产生药害。发病较重时可选用20%担菌灵乳剂每667㎡用药125-150mL或用75%担菌灵可湿性粉剂75g与异稻瘟净混用有增效作用，并可兼治稻瘟病。还可用10%灭锈胺乳剂每667㎡250ml或25%禾穗宁可湿性粉剂每667㎡用药50-70g，对水75L喷雾，效果好药效长。也可选用77%护丰安(氢氧化铜)可湿性粉剂700倍液或绿邦98水稻专用型600倍液或25%粉锈宁可湿性粉剂100g，对水75L分别在孕穗始期、孕穗末期各防1次，对病穴率、病株率及功能叶鞘病斑严重度，防效都很显著，有效地保护功能叶片。也可选用25%敌力脱乳油2000倍液于水稻孕穗期一次用药能有效地防治水稻纹枯病、叶鞘腐败病、稻曲病及稻粒黑粉病。能兼治水稻中后期多种病害。此外，提倡施用多得稀土纯营养剂。
