1、清除田间病株，生育期要拔掉发病株，烧毁或深埋土中;收获后病株残体要拣出田间烧掉。
2、实行轮作，不可与豆科、茄科等作物轮作，可与禾本科作物轮作，种植地块和前作向日葵地要保持一定距离。
3、种子处理，用60℃热水浸种10~20分钟，也可用50%菌核净按种子重量的0.5%药量拌种。花期喷施农药，用50%菌核净500倍液喷雾或50%速克灵、50%乙烯菌核利800~1000倍液，在盛花后期连喷2~3次，间隔7天喷1次。
4、选用抗病品种，增施磷钾肥提高抗病性。适期晚播，播种期移至5月下旬，使开花期错开雨季。通过深翻可把菌核埋入土层7厘米以下，减轻烂头病发生。
