洋葱腐霉根腐病病菌腐生性很强，可在土壤中长期存活，以卵孢子和菌丝形式随病残体在12～18厘米的表层土壤中越冬。此病主要侵染根系，初呈水浸状，而后产生褐斑，不长新根，植株矮小，枯萎，甚至死亡。
防治洋葱腐霉根腐病的措施：
1、 喷洒25%甲霜灵可湿性粉剂800倍液，或64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液，或75%百菌清可湿性粉剂600倍液，或40%乙磷铝可湿性粉剂200倍液，或70%百德富可湿性粉剂600倍液，或70%安泰生(丙森锌)可湿性粉剂500倍液，或69%安克锰锌1000倍液，或72. 2%普力克水剂400倍液，或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液，或15%恶霉灵水剂1000倍液等药剂，每7～10天喷1次，连续2～3次。
2、育苗用营养土应选用无病新土，如用使用过的营养土，要经过消毒后再播种。一种消毒方法是在播种前15天，用福尔马林处理营养土，每立方米床土的用药量为300毫升，稀释100倍喷洒，然后用塑料薄膜将营养土表面盖严，闷3～5天后除去覆盖物，耙松，7～10天后播种。另一种方法是，每平方米苗床用50%拌种双可湿性粉剂，或50%多菌灵可湿性粉剂，或25%甲霜灵可湿性粉剂，或50%福美双可湿性粉剂，或五代合剂(用五氯硝基苯、代森锌等量混合)8～10克，拌入10～15千克干细土配成药土，施药时先浇透底水，水渗下后，取1/3药土垫底，播种后用剩下的2/3药土覆盖在种子表面，这样“下铺上盖”，种子夹在药土中间，防效明显。在出苗前要保持苗床上层湿润，以免发生药害。
