洋葱灰腐病病原菌生成菌丝、分生孢子梗、大型分生孢子和小型分生抱子，形成菌核。分生孢子借风落至栽培田，由生长衰竭的青苗下位叶叶鞘侵入，在接近地面部位以下发病。
主要为害鳞茎和冷藏中的鳞茎。青苗期，3一5月，下数第二或第三叶片微微发黄，软化而下垂。其接近地面以下鳞茎，变为赤褐色，生出灰色粉状菌丛，形成无数分生孢子。 危害冷藏中的鳞茎。悬挂贮藏中的洋葱，菌丝由叶鞘部位侵入，到达鳞茎上部，导致鳞茎全面腐烂。染病鳞茎呈长圆形，鳞茎肩部形成不规则形的大型黑色菌核。菌核及其周边的外皮上，或与外皮之间，密生灰色绒毛状霉。
青苗在1～3月多雨时期病害比较严重.该时期的白疫病，亦可诱发本病害。 即将收获时期遇到漫灌或收获期适逢梅雨季节，有利于病害发生。迟效性肥料，导致茎粗大，鳞茎巨型，容易发生病害、因此，施肥不可过多，追肥要截止到3月上旬。不要过多施用堆肥作基肥。磷酸含量高的连作地块，施用氧化镁肥料.可以提高洋葱储藏性。要及时清理病株残体，高畦栽培，防止漫灌、收获后的洋葱，应尽早上市。需要冷藏时，必须严格筛选。架藏洋葱，以顶部干燥为重点。
