2020年6上旬至8月底，按照《农业农村部交通运输部公安部关于开展违法违规调运生猪百日专项打击行动的通知》（农牧发〔2020〕20号）要求，全市集中开展了违法违规调运生猪百日专项打击行动（以下简称百日行动），进一步巩固了生猪调运良好秩序，打击了违法违规行为，取得明显成效。
百日行动期间，全市农业农村、交通运输、公安部门主要负责同志靠前指挥，各部门协调配合，各司其职，各尽其责；各区县建立了固定站点检查与流动巡查相结合的监管模式，积极探索相邻区县联合设站、联合执法、资源共享，确保省际间、区县间生猪出入把关不留空档；建立了重庆百日行动工作微信群，落实专人收集相关情况信息，及时上报行动进展，全力推进行动有序开展。据统计，全市各区县百日行动期间共出动宣传人员3.5万余人次，发放各类宣传画报、标语等资料30万余份，举办动物防疫、调运方面的知识培训600余场次，培训相关人员1.8万余人次；全市共优化设置检查站点558个，其中省际间151个、县域间407个。
百日行动期间，全市加大执法检查力度，严厉查处了一批违法违规调运行为，进一步控制了非洲猪瘟等动物疫病的传播，切实保障了生猪生产安全。全市共出动执法人员1.8万余人次，执法车辆3800余车次，共检查巡查生猪运输车辆2.08万台次、生猪57.79万头。全市共查处违法违规调运生猪案件145件，涉案人员163人，涉案车辆90台次，其中未备案车辆35台；查处生猪3198头，其中无检疫证生猪1949头、无耳标生猪头数721头、病死生猪48头、未调运备案审批生猪1013头、未经指定道口进入生猪1338头；共行政处罚93.146万元。案件查处较多的区县有云阳16起、江津13起、潼南13起、丰都11起、万州10起。
