1、树势容易衰弱，要注意更新复壮。
矮化密植苹果树，栽植密度大，果园光照条件不如乔砧稀植园，单株挂果多，单位面积产量高，因此，肥水供应如稍有不足时，树势则很容易衰弱，若品种是短枝型品种，管理跟不上，更易早衰。由于上述原因，树进入盛果期后，有些树开花到顶，必须特别注意更新修剪。在肥水管理上要保证营养和水分的供应。修剪时要注意调整树势使其均衡，要保持中心干的生长优势，延缓衰老，延长树的经济寿命。
2、树体冠积小，应加大栽植密度。
在相同的栽培管理条件下，矮化苹果树的树冠体积小于乔砧的苹果树，单株产量低于乔砧苹果树。
栽植矮砧苹果树(包括短枝型品种)，如果象栽植乔砧苹果那样，采取稀植方式，非但不能发挥矮化树的高产优势，其单位面积产量反而会低于乔砧树。所以栽植矮化苹果树，必须要根据不同的矮化砧木和不同类型的短枝型品种，适当加大栽植密度，进行合理密植。例如：M26中间砧苹果树，一般可亩栽80-100株，M7中间砧苹果树，亩栽50-60株比较合适。
3、矮化苹果树不宜用基部三主枝、十字型等树。主枝数目要多。
矮化苹果树，栽植密度大，其树形则不宜采用主干疏层形那种多层主枝的高大树形，要采用纺锤形、细长纺锤形、或改良纺锤形树形。无论是纺锤形或细长纺锤形，有限的生长空间和植株的枝叶量的增多、增长迅速之间的矛盾，是矮化密植苹果树的主要矛盾。无论那一种纺锤形树形，其结构特点都是有主枝无侧枝，在整形修剪过程中，都要注意控制树冠的大小;主枝的数目要增多，由于主枝增多且无侧枝，就要防止主枝的生长势比中心干的生长势强，不要使树的主枝延伸生长和加粗生长太快，造成中心干的长势衰弱，每个主枝的枝体要缩小，修剪的方法要注意轻剪上下功夫。冬季修剪时，幼龄树主枝延长枝，可以不短截。
4、株数多、枝条多、叶片多。
矮化密植栽培的苹果树还有一特点是单位面积上栽植的树株数多，全园树的枝条总数及叶片总数多，大大超过乔化稀植苹果园，全园的树枝条生长条件差，每株树生长范围占面积是有限的，当一株树的叶片数量超过某一限度时，叶片必然会彼此遮荫并严重影响树冠内膛的光照，叶片通过光合作用合成的有机营养就会减少，不利于树的生长发育和成花结果。因此，应采取多种措施改善光照条件，增强叶片的光合效能。为此，冬剪应注意多疏剪少截剪，必要时夏季也要进行疏剪，及时适当调整树体结构，提高有效叶面积系数;应减少来自果园四周的遮阴，在山区建果园，要在向阳开阔地段建园;最好南北向成行栽树，长方形栽培，要行距大于株距，以利延长光照时间，增强光合效能;适当疏剪枝叶以后，要防止叶片早衰或脱落，以保证生长后期的光合作用。
